人力資源軟件項目需要多年、多方面的投資和多年預算的積累。 同時．人力資源軟件項目的成本，在項目的范圍和需要投資多少之間存在著直接的相關關系。隨著模塊的數量、流程的復雜性、地域的跨度、員工的數量和類型，增長的速度等的提高，其成本會相應提高。
實施費用是軟件費用的2～10倍，然而，通常的經驗告訴我們，成本和實施活動高度相關，即客戶化、界面、轉換以及培訓等，是軟件許可證費用的幾倍。2-3倍并非不常見，在一些復雜的例子里，l0倍或更多的費用也是可能發生的。例如，如果軟件的許可證費用是20萬美元，實施的費用則可能是40～60萬美元，在一些復雜的項目里可能會是200萬美元。事實上，復雜的項目通常都使用的是費用比較高的軟件，比如在復雜的項目里，軟件費用如果是100萬美元的話，那么實施費用可能是1000萬美元。
這些預計的成本主要包括軟件的購買、持續的維護和支持。其中的大部分費用發生在項目實施的過程中，通常在12-24個月里。不同的會計科口計算會有不同的結果；而軟件許可證的費用和硬件的費用通常被視為一個“不斷貶值”的花費，它們會有折舊費。
人力資源軟件通常可以用服務或交易的成本模型來計算，或者是以一個服務提供商租借的模式來提供，后一種可能更流行。
流行的ROI評估模型：成本／收益分析法
事實上，所有的人力資源軟件實施項目遵循著不同的ROI評估模型成本/收益分析法常常是三種模型中比較常見的一種。
首先，在行政成本上的費用減少與降低就產生了很大的收益。這些節約來自流程化、自動化的程序，因為這減少一些作業環節和人力。
節約還帶來了更多的收益，比如紙張的節約、文件的減少、速度的加快，這些節約來自軟件對上述工作的支持和維護。一定的外部成本也會取消，因為系統可以減少一些外部服務提供商。
第二，風險成本的避免也是系統帶來的收益。以前，由于信息的混亂、薪資計算的錯誤或漏檢(該取消的沒有取消)、福利計算的錯誤等，從而產生許多意想不到的風險。
第三，價值增值收益，換句話說，就是HR從一個行政管理者轉變成為企業的戰略合作伙伴所帶來的價值增值，雖然目前還很難量化計算。那些有著******商業實踐的企業都不惜在人力資源信息系統上花費以帶來企業績效的提高。畢竟，提高企業績效的******途徑就是提高企業內員工的效率和績效。
